6 сентября 1999 г. по благословению Святейшего Патриарха Алексия II на территории Академии гражданской защиты МЧС России в микрорайоне Новогорск г. Химки был совершен чин закладки храма Преосвященнейшим Саввой, епископом Красногорским. С 1 сентября 2000 года в храме стали регулярно совершаться молебны.

По благословению Святейшего Патриарха 25 декабря 2002 года храм был освящен иерейским чином, его совершил протоиерей Стефан Пристая.

Указом Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексия II от 2003 года было учреждено Патриаршее подворье. В 2014 году храм вошел в состав Химкинского благочиния в статусе приписного храма к церкви Богоявления Господня г. Химки.

В настоящее время при храме действует воскресная школа, проводятся беседы для взрослых, организуются паломнические поездки. Богослужения совершаются по субботам и воскресеньям, а также в великие и двунадесятые праздники.